有人提出以 3’未轉譯區域成為基因序列標幟位置(gene-specific sequence-tagged sites) 的策略(Wilcox,
et al, 1991)。由於各個不同基因的 3’未轉譯區域大多是獨特的，因此用來作為特定基因的標幟是很恰當的選擇，更好的是可以避免 intron 的干擾。但是若以這種方式來進行，就必須要有許多已知基因的序列才行。因此，為了改良這個缺點，另外一組研究人員就提出了利用表現序列標幟來輔助基因定位的概念(Adams, et al, 1991)。
表現序列標幟 (Expressed sequence tag, EST)