GenWeb Searches -- 選擇序列搜尋的方法(algorithms)
關 於 各 搜 尋 方 法 的 介 紹 請 參 照 GenWeb 系 統 簡 介 。
請 務 必 在 此 畫 面 先 選 好 Query type 及 Database Type 再 進 入 系 統 執 行 , 以 免 因 選 項 錯 誤 造 成 系 統 問 題 !
Query Type
表 示 現 有 欲 比 對 的 序 列 種 類 , 可 選 擇 protein, DNA 或 profile , 若 一 次 需 比 對 多 種 類 型 的 序 列 , 也 可 以 選 All 。 在 這 裏 先 填 入 序 列 種 類 可 以 省 去 進 入 後 不 知 道 如 何 選 擇 application 的 困 擾 。 例 如 執 行 Blast 時 Query 為 protein, Database 為 DNA 時 , 進 入 後 application 會 自 動 選 擇 tblastn 。
表 示 欲 比 對 之 資 料 庫 類 型 , 以 現 有 資 料 庫 為 例 : 若 選 擇 protein , 則 所 比 對 的 是 Swiss-Prot 資 料 庫 , 若 選 擇 DNA , 則 所 比 對 的 是 GenBank 或 GDEST 資 料 庫 。資 料 庫 內 容 會 因 管 理 者 所 載 入 的 資 料 而 有 所 不 同 。
由 此 進 入 可 直 接 進 行 序 列 搜 尋 , 適 合 一 般 使 用 者 。
在 此 模 式 下 進 行 序 列 搜 尋 時, 可 隨 使 用 者 需 要 修 改 某 些 參 數 , 適 合 有 特 殊 需 求 的 使 用 者 。
