使 用 Graphic Result Viewer 看 結 果
若 看 結 果 時 勾 選 Activate graphic results viewer,
則 在 顯 示 結 果 的 文 字 說 明 時 會 同 時 出 現 以 下 的 圖 形 :
Zoom level
以 此 調 整 中 間 圖 形 的 細 節 的 放 大 和 縮 小 , Min 是 縮 至 最 小 , 可 以 看
整 個 序 列 alignment 的 分 佈 情 形 ; Max 是 放 至 最 大 , 可 以 細 看 各 序 列 的
符 號 為 何 ; "-" 和 "+" 則 可 以 用 來 微 調 至 使 用 者 所 想 要 的 倍 數 ; 上 方
的 數 字 則 表 示 放 大 與 縮 小 的 倍 數 。
DVS Mode
Detail View Screen mode , 若 是 想 細 看 某 一 個 結 果 序 列 和 query 序 列 的 比 對 情
形 , 只 要 對 結 果 序 列 連 按 兩 下 滑 鼠 , 就 會 出 現 新 的 視 窗 顯 示 細 部 的 比 對
情 形 ( 如 下 圖 ) 。
- Single view -- 一 次 只 能 顯 示 一 個 視 窗 , 新 的 視 窗 會 將
舊 的 蓋 掉 。
- Multi view -- 一 次 可 以 顯 示 多 個 視 窗 , 可 以 互 相 比 較 比
對 結 果 。
Color Mode
調 整 圖 形 顯 示 的 色 彩 :
- Sequence -- 將 每 一 個 序 列 都 以 不 同 顏 色 顯 示 , 如 上 圖 。
- Match -- 依 query 序 列 和 結 果 序 列 間 的 相 似 程 度 以 不 同 顏 色
顯 示 ; 紅 色 代 表 Match , 灰 色 代 表 Mismatch , 黃 色 代 表 Similarity 。
- QFrame -- 如 果 以 核 酸 來 比 對 蛋 白 質 資 料 庫 時 , 結 果 的 顯 示
會 依 不 同 的 reading frame 以 不 同 的 顏 色 來 顯 示 。
- SFrame -- 如 果 以 蛋 白 質 來 進 行 比 對 時 , 結 果 的 顯 示
會 依 不 同 的 reading frame 以 不 同 的 顏 色 來 顯 示 。
NCBI & SRS
在 DVA mode 時 會 有 兩 個 按 鍵 , 可 以 連 至 該 結 果 序 列 的 報 告 :
- NCBI -- 可 直 接 連 至 美 國 的 Natioanl Center of Biotechnology
Information 的 GenBank 查 看 該 序 列 在 Genbank Entrez 中 的 原 始 資 料 , 並 可 由 此
連 至 其 他 資 料 庫 。
- SRS -- 可 直 接 連 至 英 國 的 European Bioinformatics Institute
查 看 該 序 列 在 EMBL , Swiss-prot 中 的 原 始 資 料 , 並 可 由 此
連 至 其 他 資 料 庫 。
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請惠賜意見 Last updated 1998/10/28
