The Blosum62 Amino Acid
Substitution Matrix
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
A 4
R
-1 5
N
-2 0 6
D
-2 -2 1
6
C 0 -3 -3 -3 9
Q
-1 1 0 0 -3 5
E
-1 0 0 2 -4 2
5
G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6
H
-2 0 1 -1 -2 0 0 -2 8
I
-1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4
L
-1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2
4
K
-1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3
-1 5
M
-1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1
2 -1 5
F
-2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6
P
-1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7
S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4
T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2
-1 1
5
W
-3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 1 -4 -3 -2 11
Y
-2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2
-1 3 -3 -2
-2 2
7
V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3
-3 3
1 -2 1 -1 -2
-2 0 -3 -1 4